El P. Nicolás, "que molts dèiem afectuosament Adolfo, i els jesuïtes d'Àsia Pacífic, Nico", diu a la carta el P. Arturo, havia nascut a Palència el 1936, va entrar al noviciat dels jesuïtes d'Aranjuez el 1953. amb 24 anys va ser destinat al Japó. Des d'aquest moment fins a la seva elecció com a Superior General, el 2008, va treballar a Àsia, sobretot al Japó i les Filipines, exercint diferents càrrecs, entre ells el de Provincial del Japó durant la dècada dels 90, o el de moderador dels Provincials Jesuïtes d'Àsia Oriental i Oceania. Durant deu anys va viure a les Filipines, exercint com a director de l'Institut de Pastoral de l'Extrem Orient (EAPI) i com a President de la Conferència de Provincials d'Àsia Oriental i Oceania. Després d'haver presentat la seva dimissió com a General de la Companyia, va ser director espiritual en l'EAPI i en la Residència Internacional Arrupe de Manila. També va treballar amb població immigrant i desfavorida en una parròquia de Tokio.
El 2008, després de la renúncia del P. Peter-Hans Kolvenbach, va ser triat per la Congregació General 35 com a Superior General dels jesuïtes, convertint-se en el vintè novè successor de Sant Ignasi i el setè jesuïta de nacionalitat espanyola que ocupava aquest càrrec. Al seu generalat va aportar el seu coneixement i sensibilitat de les cultures orientals, l'espiritualitat en diàleg amb altres religions i va reafirmar el compromís prioritari per la promoció de la justícia i la reconciliació.
Al llarg d'aquests anys va liderar un treball d'intensa reestructuració de les províncies jesuïtes europees i americanes i, sobretot, va insistir repetidament en la necessitat de combatre la superficialitat, treballant des de la profunditat i la creativitat. Al llarg del seu govern va animar els jesuïtes a redescobrir la dimensió universal de la Companyia de Jesús i a impulsar la col·laboració amb altres, creients o no. Alguns dels accents de la seva generalat van ser el treball en favor dels més desfavorits, l'ecologia, la reconciliació i el treball per la pau com a principi irrenunciable; així com l'educació dels joves.
En 2014, a l'edat de 78 anys, va anunciar la seva voluntat de presentar la renúncia, el que va fer davant la Congregació General 36, celebrada a Roma el 2016.